La Fiscalía General de la República (FGR) abrió dos carpetas de investigación relacionadas con los hechos ocurridos en Chihuahua; una de ellas por el narcolaboratorio desmantelado en un operativo realizado los días 17 y 18 de abril, y la segunda por la presunta participación de elementos de la Agencia Central de Inteligencia (CIA, por sus siglas en inglés) en acciones antidrogas en colaboración con mandos de la Agencia Estatal de Investigación (AEI), por posibles delitos en materia de seguridad nacional.
La institución que dirige Ernestina Godoy Ramos informó que, en el caso de los agentes de la CIA –dos de cuatro de ellos fallecieron en un accidente automovilístico junto con el director de la AEI, Pedro Oseguera, y el agente de la corporación estatal, Manuel Méndez–, luego de participar en el operativo antidrogas, se inició la indagatoria “por sus características y relevancia, además de considerarse la posibilidad de que se hayan cometido delitos en materia de seguridad nacional”.